"SSSS.Gridman" ist eine Anime-Adaption des klassischen Tokusatsu-Serials "Gridman the Hyper Agent" aus den 1990er Jahren. Die Handlung spielt in der fiktiven Stadt Tsutsujidai, die von einer seltsamen Ruhe und einer Reihe unerklärlicher Phänomene geprägt ist. Der Protagonist Yuta Hibiki erwacht eines Tages ohne Erinnerungen und entdeckt, dass er mit einem mysteriösen Wesen namens Gridman verschmolzen ist. Gridman ist ein digitaler Held, der aus der Computerwelt stammt und die Fähigkeit besitzt, in einen riesigen Roboter zu transformieren, um gegen Monster zu kämpfen.

Yuta wird von seinen Klassenkameraden Rikka Takarada und Shou Utsumi unterstützt, die ihm helfen, seine Rolle als Gridman zu verstehen und die Bedrohungen zu bekämpfen. Rikka ist eine ruhige und pragmatische Schülerin, während Shou ein technikbegeisterter Freund ist, der Gridmans Systeme analysiert und verbessert. Gemeinsam stehen sie einer Reihe von Monstern gegenüber, die von einem mysteriösen Antagonisten namens Alexis Kerib erschaffen werden. Alexis ist ein mächtiges Wesen aus der digitalen Welt, das die reale Welt manipulieren und zerstören will.

Im Laufe der Geschichte wird deutlich, dass Tsutsujidai keine gewöhnliche Stadt ist, sondern eine künstlich geschaffene Welt, die von Alexis und einer weiteren Figur namens Akane Shinjou kontrolliert wird. Akane ist eine Schülerin, die scheinbar ein normales Leben führt, aber in Wirklichkeit die Fähigkeit besitzt, Monster zu erschaffen und die Realität nach ihren Wünschen zu formen. Ihre Motivation und ihre Beziehung zu Alexis werden im Verlauf der Handlung immer komplexer, während Yuta und Gridman versuchen, die Wahrheit über die Stadt und ihre eigene Existenz aufzudecken.

Die Handlung entwickelt sich zu einem Konflikt zwischen den Kräften des Guten, repräsentiert durch Gridman und seine Verbündeten, und den destruktiven Absichten von Alexis und Akane. Dabei werden Themen wie Identität, Realität und die Konsequenzen menschlicher Handlungen erkundet. Die finale Konfrontation führt zu einer Auflösung der künstlichen Welt und einer Rückkehr zur wahren Realität, wobei die Charaktere mit den Konsequenzen ihrer Entscheidungen konfrontiert werden.