"Kunoichi Sakuya" (OVA) handelt von der jungen Kunoichi Sakuya, einer Ninja-Ausbildungsschülerin, die in einer Welt voller Gefahren und politischer Intrigen lebt. Die Handlung beginnt mit Sakuya, die in einem abgelegenen Dorf aufwächst und von ihrem Meister in den Kampfkünsten unterrichtet wird. Ihr Leben ändert sich schlagartig, als ihr Dorf von einer mysteriösen Gruppe angegriffen wird, die nach einem mächtigen Artefakt suchen, das im Besitz des Dorfes ist. Sakuya überlebt den Angriff und schwört Rache, während sie gleichzeitig versucht, das Artefakt zu schützen.

Auf ihrer Reise trifft Sakuya auf verschiedene Charaktere, darunter den rätselhaften Krieger Kagetora, der ihr sowohl als Verbündeter als auch als Herausforderung dient. Zusammen decken sie eine Verschwörung auf, die das Gleichgewicht der Macht in ihrer Welt bedroht. Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von Kämpfen, strategischen Manövern und Enthüllungen über die wahre Natur des Artefakts, das nicht nur eine Waffe, sondern auch ein Schlüssel zu einer uralten Macht ist.

Die Charaktere sind vielfältig und komplex, wobei Sakuya als Protagonistin durch ihre Entschlossenheit und ihr Wachstum im Laufe der Geschichte im Mittelpunkt steht. Kagetora, ein erfahrener Krieger mit einer undurchsichtigen Vergangenheit, dient als Mentor und Gegenspieler zugleich. Antagonisten wie der skrupellose Anführer der feindlichen Gruppe, der das Artefakt für seine eigenen machthungrigen Ziele nutzen will, tragen zur Spannung bei.

Die Handlung ist geprägt von Action, politischen Intrigen und moralischen Dilemmata, wobei die Themen Loyalität, Rache und die Suche nach der eigenen Identität im Vordergrund stehen. Die OVA bietet eine abgeschlossene Geschichte, die jedoch Raum für Interpretationen und weiterführende Entwicklungen lässt.