"Fullmetal Alchemist the Movie: Conqueror of Shamballa" ist ein Anime-Film, der direkt an die Handlung der Serie "Fullmetal Alchemist" (2003) anschließt. Der Film spielt in einer alternativen Realität, in der Edward Elric nach den Ereignissen der Serie in die Welt des frühen 20. Jahrhunderts, genauer gesagt nach München im Jahr 1923, verschlagen wurde. In dieser Welt existiert keine Alchemie, und Edward versucht verzweifelt, einen Weg zurück in seine Heimatwelt zu finden, um seinen Bruder Alphonse wiederzusehen.

In München trifft Edward auf eine Gruppe von Roma, darunter die junge Frau Noah, die ihm hilft, sich in dieser fremden Welt zurechtzufinden. Gleichzeitig wird er mit den politischen und sozialen Unruhen der Zeit konfrontiert, darunter die aufkeimende nationalsozialistische Bewegung. Edward erfährt, dass es in dieser Welt eine Verbindung zu seiner eigenen gibt, und dass die mysteriöse Stadt Shamballa als Brücke zwischen den Welten dient.

Parallel dazu wird in Edwards Heimatwelt gezeigt, wie Alphonse weiterhin nach einem Weg sucht, seinen Bruder zurückzuholen. Alphonse arbeitet mit alten Freunden und Verbündeten zusammen, darunter Winry Rockbell und Colonel Roy Mustang, um die Geheimnisse der Alchemie und der Dimensionstüren zu erforschen. Dabei stößt er auf Hinweise, die auf eine mögliche Verbindung zwischen den Welten hindeuten.

Im Laufe des Films wird deutlich, dass die beiden Welten durch eine Reihe von Ereignissen miteinander verflochten sind. Edward und Alphonse müssen letztlich gemeinsam gegen eine Bedrohung kämpfen, die beide Welten gefährdet. Der Film kulminiert in einer dramatischen Konfrontation, bei der Edward und Alphonse gezwungen sind, schwierige Entscheidungen zu treffen, um das Gleichgewicht zwischen den Welten wiederherzustellen.

Die Charaktere Edward und Alphonse Elric stehen im Mittelpunkt der Handlung, wobei ihre Beziehung und ihr unerschütterlicher Wille, füreinander da zu sein, zentrale Themen sind. Nebenfiguren wie Noah, Winry Rockbell und Roy Mustang spielen wichtige Rollen, um die Handlung voranzutreiben und die emotionalen und thematischen Tiefen der Geschichte zu erweitern. Der Film verbindet Elemente von Abenteuer, Science-Fiction und historischem Drama, während er die komplexe Beziehung zwischen den beiden Welten und ihren Bewohnern erforscht.