"Puella Magi Madoka Magica scene0" ist ein Anime, der als Prolog zur Hauptserie "Puella Magi Madoka Magica" fungiert und die Hintergründe der Welt und der Charaktere einführt. Die Handlung spielt in einer Stadt, in der junge Mädchen die Möglichkeit erhalten, magische Kräfte zu erlangen, indem sie einen Vertrag mit einem mysteriösen Wesen namens Kyubey abschließen. Im Austausch für die Erfüllung eines Wunsches werden sie zu Magical Girls, die gegen dunkle Wesen, sogenannte "Witches", kämpfen müssen.

Die Protagonistin Madoka Kaname, ein normales Schulmädchen, wird von Kyubey angesprochen und erfährt von der Existenz der Magical Girls. Zusammen mit ihrer besten Freundin Sayaka Miki trifft sie auf Mami Tomoe, eine erfahrene Magical Girl, die sie in die Welt der Witches und die Gefahren, die damit verbunden sind, einführt. Mami zeigt ihnen die Kämpfe gegen die Witches, die in labyrinthartigen Dimensionen stattfinden, und erklärt, dass die Magical Girls ihre Kräfte durch sogenannte "Grief Seeds" aufrechterhalten müssen, die sie nach dem Besiegen einer Witch erhalten.

Während Madoka und Sayaka überlegen, ob sie den Vertrag mit Kyubey eingehen sollen, taucht eine rätselhafte Magical Girl namens Homura Akemi auf, die Madoka eindringlich warnt, niemals einen Vertrag mit Kyubey abzuschließen. Homuras Motive und ihre Beziehung zu Madoka bleiben zunächst undurchsichtig, doch ihre düsteren Vorahnungen deuten auf eine tiefere Tragödie hin, die mit dem Leben als Magical Girl verbunden ist.

Der Anime legt die Grundlage für die komplexe und oft düstere Erzählung der Serie, indem er die scheinbar märchenhafte Idee der Magical Girls mit den harten Realitäten und moralischen Dilemmata konfrontiert, die mit ihrer Existenz verbunden sind. Die Charaktere werden in ihrer Unschuld und ihrem Idealismus gezeigt, während gleichzeitig die dunklen Geheimnisse und Konsequenzen ihrer Entscheidungen angedeutet werden.