"World Trigger" spielt in der fiktiven Stadt Mikado City, die regelmäßig von mysteriösen Wesen, den sogenannten Neighbors, angegriffen wird. Diese Wesen stammen aus einer anderen Dimension und bedrohen die menschliche Bevölkerung. Zum Schutz der Stadt wurde die Organisation Border gegründet, die aus Agenten besteht, die mit speziellen Waffen, den Trion-Körpern und Triggers, ausgestattet sind. Diese Technologie ermöglicht es den Agenten, gegen die Neighbors zu kämpfen und die Stadt zu verteidigen.

Die Handlung konzentriert sich auf Osamu Mikumo, einen jungen und relativ unerfahrenen Border-Agenten, der sich trotz seiner begrenzten Fähigkeiten bemüht, seine Stadt zu schützen. Osamu trifft auf Yūma Kuga, einen mysteriösen Jungen, der sich als Neighbor entpuppt, aber friedliche Absichten hat. Yūma besitzt einen einzigartigen Trigger, der ihm übermenschliche Kräfte verleiht, und schließt sich Osamu an, um gemeinsam gegen die Bedrohung zu kämpfen. Später stößt Chika Amatori, ein Mädchen mit außergewöhnlich hohem Trion-Level, zu ihnen und bildet mit Osamu und Yūma ein Team.

Die Serie folgt den drei Protagonisten, während sie sich in der Hierarchie von Border hocharbeiten, an Missionen teilnehmen und sich auf Ranglistenkämpfe vorbereiten. Diese Kämpfe sind entscheidend, um in höhere Ränge aufzusteigen und an gefährlichen Expeditionen in die Nachbar-Dimension teilzunehmen. Dabei werden sie mit verschiedenen Herausforderungen konfrontiert, darunter interne Konflikte innerhalb von Border, die komplexe Natur der Neighbors und die moralischen Dilemmata, die mit dem Einsatz von Trion-Technologie verbunden sind.

Die Charaktere entwickeln sich im Laufe der Serie weiter, wobei ihre Beziehungen zueinander und ihre individuellen Ziele im Mittelpunkt stehen. Osamu strebt danach, stärker zu werden, um seine Freunde zu schützen, während Yūma versucht, seine Vergangenheit aufzuklären und seinen Platz in der menschlichen Welt zu finden. Chika hingegen muss lernen, mit ihrer enormen Kraft umzugehen und ihre Ängste zu überwinden.

"World Trigger" kombiniert strategische Kämpfe, Teamarbeit und Weltbuilding, wobei die Handlung sowohl auf die persönlichen Entwicklungen der Charaktere als auch auf die größeren Konflikte zwischen den Dimensionen eingeht. Die Serie bietet eine Mischung aus Action, Spannung und emotionalen Momenten, die durch die komplexen Beziehungen und die taktische Natur der Kämpfe geprägt sind.