"Detective Conan: Quarter of Silence" ist der 15. Kinofilm der "Detective Conan"-Reihe und spielt in einer abgelegenen Bergregion Japans. Der Film beginnt mit einem mysteriösen Vorfall, bei dem ein Zug entgleist und eine Brücke zerstört wird. Conan Edogawa, Shinichi Kudo in der Gestalt eines Kindes, reist mit seinen Freunden Ran Mouri und Kogoro Mouri sowie der Detective Boys-Gruppe in die Region, um den Fall zu untersuchen. Der Unfall steht im Zusammenhang mit einem geplanten Bauprojekt, das eine umstrittene Staudammkonstruktion vorsieht. Die lokale Bevölkerung ist gespalten, da das Projekt sowohl wirtschaftliche Vorteile als auch ökologische Risiken birgt.

Während der Ermittlungen wird ein Mord an einem Ingenieur des Projekts aufgedeckt, der scheinbar mit dem Zugunglück in Verbindung steht. Conan entdeckt, dass der Mord Teil eines größeren Komplotts ist, das auf die Verhinderung des Staudammbaus abzielt. Ein geheimnisvoller Mann namens Kuramoto, der als Anführer einer lokalen Protestgruppe gilt, gerät ins Visier der Ermittlungen. Gleichzeitig tauchen Hinweise auf, dass eine terroristische Gruppe hinter den Anschlägen stecken könnte, um die Region in Angst und Schrecken zu versetzen.

Conan und seine Freunde müssen gegen die Zeit arbeiten, um weitere Anschläge zu verhindern und die wahren Schuldigen zu entlarven. Dabei stoßen sie auf eine komplexe Verschwörung, die politische Korruption, Umweltaktivismus und persönliche Rache miteinander verbindet. Der Film kombiniert Spannung, Action und klassische Detektivarbeit, wobei Conans scharfer Verstand und seine Fähigkeit, scheinbar unbedeutende Hinweise zu verknüpfen, im Mittelpunkt stehen. Die Handlung gipfelt in einem dramatischen Finale, bei dem Conan nicht nur die Wahrheit aufdeckt, sondern auch Leben retten muss, bevor es zu spät ist.