"Sound! Euphonium 2" setzt die Geschichte der Kitauji-Oberschulblaskapelle fort, die sich nach den Ereignissen der ersten Staffel weiterentwickelt. Die Handlung konzentriert sich erneut auf Kumiko Oumae, eine Euphoniumspielerin, die sich mit den Herausforderungen des Schulalltags, der Musik und zwischenmenschlichen Beziehungen auseinandersetzt. Nachdem die Blaskapelle bei den regionalen Wettbewerben erfolgreich war, streben sie nun den Einzug in die nationalen Wettbewerbe an. Dabei stehen nicht nur musikalische Höchstleistungen im Mittelpunkt, sondern auch die persönlichen Konflikte und Dynamiken innerhalb der Gruppe.

Ein zentraler Konflikt der zweiten Staffel dreht sich um Asuka Tanaka, die talentierte, aber rätselhafte Präsidentin der Blaskapelle. Ihre zurückhaltende Art und ihre Entscheidungen führen zu Spannungen innerhalb der Gruppe, insbesondere als sie sich weigert, ihre persönlichen Gründe für ihr Verhalten preiszugeben. Kumiko, die eine enge Beziehung zu Asuka aufbaut, versucht, deren Geheimnisse zu ergründen und gleichzeitig die Harmonie in der Gruppe zu bewahren. Parallel dazu wird die Freundschaft zwischen Kumiko und Reina Kousaka vertieft, wobei ihre gemeinsame Leidenschaft für Musik und ihre gegenseitige Unterstützung im Vordergrund stehen.

Ein weiterer Handlungsstrang befasst sich mit der Rückkehr von Nozomi Kasaki und Mizore Yoroizuka, zwei ehemaligen Mitgliedern der Blaskapelle, die aufgrund vergangener Konflikte die Gruppe verlassen hatten. Ihre Rückkehr löst gemischte Gefühle aus, insbesondere bei Mizore, die Schwierigkeiten hat, sich wieder in die Gruppe zu integrieren. Die Staffel beleuchtet ihre Vergangenheit und die Gründe für ihre Abwesenheit, während sie sich bemühen, ihren Platz in der Gruppe zurückzuerobern und ihre Freundschaft zu stärken.

Die Handlung verbindet die persönlichen Entwicklungen der Charaktere mit den kollektiven Anstrengungen der Blaskapelle, sich für die nationalen Wettbewerbe zu qualifizieren. Dabei werden Themen wie Teamarbeit, persönliche Ambitionen und die Bedeutung von Kommunikation und Verständnis innerhalb einer Gruppe behandelt. Die Staffel endet mit einem emotionalen Höhepunkt, der die Fortschritte der Charaktere und ihre gemeinsame Leidenschaft für die Musik unterstreicht.