"Miss Kuroitsu aus der Monsterentwicklungsabteilung" ist eine Anime-Serie, die in einer Welt spielt, in der böse Organisationen und Helden im Stil von Super Sentai oder Kamen Rider regelmäßig gegeneinander antreten. Die Geschichte konzentriert sich auf die Monsterentwicklungsabteilung von Agastia, einer bösen Organisation, die versucht, die Welt zu erobern. Die Protagonistin, Touka Kuroitsu, ist eine talentierte Wissenschaftlerin, die in dieser Abteilung arbeitet und dafür verantwortlich ist, Monster zu entwickeln, die gegen die Helden kämpfen können.

Touka Kuroitsu steht unter ständigem Druck, innovative und mächtige Monster zu erschaffen, um die Pläne von Agastia voranzutreiben. Dabei muss sie sich mit begrenzten Budgets, inkompetenten Kollegen und den oft unrealistischen Erwartungen ihrer Vorgesetzten auseinandersetzen. Ihre Arbeit wird zusätzlich erschwert durch die regelmäßigen Niederlagen ihrer Monster gegen die Helden, was zu frustrierenden Rückschlägen führt.

Ein zentraler Charakter ist Wolf Bete, ein von Kuroitsu entwickeltes Monster, das menschliche Züge aufweist und sich durch seine Naivität und Gutmütigkeit auszeichnet. Wolf Bete wird oft als Testobjekt eingesetzt, zeigt jedoch wenig Interesse daran, böse zu sein, was zu komischen und unerwarteten Situationen führt. Die Dynamik zwischen Kuroitsu und Wolf Bete bildet einen wichtigen Teil der Handlung und trägt zur humorvollen Note der Serie bei.

Neben den internen Herausforderungen von Agastia gibt es auch externe Bedrohungen, wie die Heldenorganisation "Divine Swords", die regelmäßig gegen die Monster von Agastia kämpft. Die Serie beleuchtet die Absurditäten und Schwierigkeiten, die mit dem Leben in einer bösen Organisation verbunden sind, und bietet dabei eine satirische Perspektive auf klassische Tokusatsu- und Superhelden-Tropen.

Die Handlung wird durch eine Vielzahl von Nebencharakteren bereichert, darunter Kollegen aus der Monsterentwicklungsabteilung, Vorgesetzte von Agastia und Mitglieder von Divine Swords. Jeder Charakter trägt auf seine Weise zur Handlung bei, sei es durch komische Interaktionen, absurde Ideen oder unerwartete Entwicklungen.

Insgesamt bietet die Serie eine humorvolle und oft absurde Darstellung des täglichen Lebens in einer bösen Organisation, wobei sie gleichzeitig die Klischees und Konventionen des Genres auf unterhaltsame Weise parodiert.