"Monster Strike the Animation" basiert auf dem gleichnamigen mobilen Spiel und erzählt eine abenteuerliche Geschichte, die sich um die Rettung der Welt dreht. Die Handlung beginnt mit dem Protagonisten Haruto, einem Schüler, der eines Tages auf mysteriöse Weise in eine andere Dimension gezogen wird. Dort trifft er auf einen kleinen Drachen namens Oragon, der ihm die Fähigkeit verleiht, Monster zu beschwören und zu bekämpfen. Haruto erfährt, dass er als "Striker" auserwählt wurde, um die Welt vor einer drohenden Katastrophe zu bewahren.

Die Welt von "Monster Strike" ist in verschiedene Reiche unterteilt, die von mächtigen Monstern bewohnt werden. Haruto und seine Freunde, darunter die mutige Aoi und der intelligente Ren, reisen durch diese Reiche, um mächtige Monster zu sammeln und zu stärken. Ihr Ziel ist es, die "Monster Strike"-Kugeln zu finden, die die Schlüssel zur Rettung der Welt sind. Auf ihrer Reise begegnen sie zahlreichen Gegnern, darunter die Organisation "Eclipse", die die Monster Strike-Kugeln für ihre eigenen dunklen Zwecke nutzen will.

Die Charaktere entwickeln sich im Laufe der Serie weiter, während sie sich mit ihren eigenen Ängsten und Schwächen auseinandersetzen. Haruto lernt, Verantwortung zu übernehmen, Aoi entdeckt ihre innere Stärke, und Ren findet Wege, seine Intelligenz für das Team einzusetzen. Die Beziehung zwischen Haruto und Oragon spielt eine zentrale Rolle, da sie gemeinsam wachsen und sich auf ihre Mission vorbereiten.

Die Serie kombiniert Action, Fantasy und emotionale Momente, während die Charaktere gegen immer stärkere Gegner antreten. Die Handlung wird durch episodenweise Abenteuer vorangetrieben, die in einem größeren narrativen Rahmen eingebettet sind. Dabei werden Themen wie Freundschaft, Mut und die Bedeutung von Teamarbeit immer wieder aufgegriffen. Die finale Konfrontation mit den Kräften der Finsternis bildet den Höhepunkt der Serie, in der die Charaktere alles aufs Spiel setzen, um die Welt zu retten.