"Space Sagittarius" ist eine Science-Fiction-Anime-Serie, die in einer fernen Zukunft spielt, in der die Menschheit das Sonnensystem kolonisiert hat und interstellare Reisen möglich sind. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe von Außenseitern, die sich auf einem alten, heruntergekommenen Raumschiff namens "Sagittarius" zusammenfinden. Das Schiff, einst ein stolzer Teil der Raumflotte, ist nun ein Schrottplatz für veraltete Technologie und dient als Zufluchtsort für diejenigen, die am Rande der Gesellschaft stehen.

Die Hauptfigur ist Kaito, ein ehemaliger Pilot, der nach einem tragischen Vorfall aus der Raumflotte ausgeschlossen wurde. Kaito wird von einer mysteriösen Frau namens Lyra angesprochen, die ihn überredet, die "Sagittarius" zu übernehmen und eine gefährliche Mission zu starten. Lyra behauptet, im Besitz von Informationen zu sein, die die Machtverhältnisse im Universum verändern könnten, und benötigt Kaitos Fähigkeiten, um diese Informationen sicher zu transportieren. Zusammen mit einer bunten Crew, darunter der exzentrische Ingenieur Jiro, die stoische Kampfpilotin Aya und der undurchsichtige Hacker Ren, begibt sich die Gruppe auf eine Reise durch gefährliche Regionen des Weltraums.

Die Serie verbindet episodische Abenteuer mit einer übergeordneten Handlung. Jede Episode stellt die Crew vor neue Herausforderungen, sei es durch feindliche Raumschiffe, korrupte Regierungsbeamte oder die Gefahren des Weltraums selbst. Gleichzeitig wird die Vergangenheit der Charaktere nach und nach enthüllt, wobei sich zeigt, dass jeder von ihnen ein Geheimnis mit sich trägt, das sie auf der "Sagittarius" vereint. Die Beziehungen zwischen den Charakteren entwickeln sich im Laufe der Serie, wobei Vertrauen und Loyalität immer wieder auf die Probe gestellt werden.

Ein zentrales Thema der Serie ist die Suche nach Identität und Zugehörigkeit in einer Welt, die von Machtkämpfen und sozialer Ungleichheit geprägt ist. Die "Sagittarius" wird nicht nur als Raumschiff, sondern auch als Symbol für Hoffnung und Widerstand dargestellt, da die Crew gegen übermächtige Gegner kämpft, um ihre Freiheit und ihre Zukunft zu sichern. Die Serie endet mit einem offenen Finale, das Raum für Interpretationen lässt und die Zuschauer mit Fragen über die Zukunft der Charaktere und des Universums zurücklässt.