Die OVA "Prefectural Earth Defense Force" spielt in einer fiktiven japanischen Präfektur, in der eine Gruppe von Außerirdischen, bekannt als die "Galactic Empire Army", die Erde angreift. Die Geschichte konzentriert sich auf die Präfekturverwaltung, die gezwungen ist, eine eigene Verteidigungstruppe zu bilden, um die Invasion abzuwehren. Die Handlung beginnt mit dem plötzlichen Auftauchen der außerirdischen Streitkräfte, die mit überlegenen Technologien und Waffen ausgestattet sind. Die Präfekturregierung, die von der Zentralregierung vernachlässigt wird, beschließt, eigenständig zu handeln, und stellt eine bunt zusammengewürfelte Gruppe von Beamten und Bürgern zusammen, die die "Prefectural Earth Defense Force" bilden.

Die Hauptfiguren sind typische Büroangestellte und Beamte, die keine militärische Ausbildung haben und eher zufällig in ihre neuen Rollen als Verteidiger der Erde geraten. Zu den zentralen Charakteren gehören ein fauler, aber gutherziger Büroangestellter, eine ehrgeizige Sekretärin und ein älterer Beamter, der sich widerwillig der Sache anschließt. Die Gruppe muss nicht nur gegen die außerirdischen Invasoren kämpfen, sondern auch mit bürokratischen Hindernissen, begrenzten Ressourcen und ihrer eigenen Unerfahrenheit zurechtkommen.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von humorvollen und absurden Situationen, in denen die Protagonisten versuchen, ihre improvisierten Verteidigungsstrategien umzusetzen. Dabei werden sie oft von den Außerirdischen überrascht, die trotz ihrer technologischen Überlegenheit ebenfalls mit eigenen Schwächen und Absurditäten zu kämpfen haben. Die OVA verbindet Science-Fiction-Elemente mit satirischem Humor, der die Ineffizienz von Bürokratie und die Absurdität von Alltagssituationen in den Vordergrund stellt.

Im Verlauf der Geschichte gelingt es der "Prefectural Earth Defense Force" schließlich, durch unkonventionelle Methoden und Teamarbeit einige Erfolge gegen die Invasoren zu erzielen. Die OVA endet mit einem offenen Ausgang, der Raum für Interpretationen lässt, aber dennoch die Absurdität und den Charme der Geschichte unterstreicht.