"Intrigue in the Bakumatsu - Irohanihoheto" ist eine Anime-Serie, die in der späten Edo-Zeit Japans, während der turbulenten Bakumatsu-Periode, spielt. Die Handlung dreht sich um Akizuki Yojiro, einen rätselhaften Wanderer und Schwertkämpfer, der von einem mysteriösen Artefakt namens "Konpeki no Sōshi" verfolgt wird. Dieses Artefakt besitzt eine unheilvolle Kraft und zieht sowohl menschliche als auch übernatürliche Feinde an. Yojiro reist durch das Land, um das Artefakt zu zerstören und gleichzeitig die Geister der Vergangenheit zu bekämpfen, die mit seiner eigenen Geschichte verflochten sind.

Auf seiner Reise trifft Yojiro auf eine Theatergruppe namens "Kotetsu no Kai", die als Deckmantel für ihre eigentliche Tätigkeit als Söldner und Informanten dient. Die Gruppe besteht aus charismatischen Charakteren wie der mutigen Schauspielerin Yuyama Kakunojo, dem strategisch denkenden Anführer Kanna und anderen Mitgliedern, die jeweils ihre eigenen Motive und Hintergründe haben. Zusammen mit ihnen gerät Yojiro in politische Intrigen, die die Zukunft Japans beeinflussen, während er gleichzeitig gegen übernatürliche Bedrohungen kämpft, die durch das Artefakt hervorgerufen werden.

Die Serie verbindet historische Elemente der Bakumatsu-Zeit, wie den Konflikt zwischen den Anhängern des Shogunats und den Befürwortern der Meiji-Restauration, mit übernatürlichen und mystischen Themen. Yojiros persönliche Mission, das Artefakt zu zerstören, wird durch seine Begegnungen mit historischen Figuren und fiktiven Charakteren vorangetrieben, die alle in die komplexen politischen und sozialen Umwälzungen der Zeit verstrickt sind. Die Handlung ist geprägt von Spannung, Action und einer düsteren Atmosphäre, die die Unsicherheit und den Wandel der Epoche widerspiegelt.