"Origin ~Spirits of the Past~" ist ein Science-Fiction-Anime-Film, der in einer postapokalyptischen Zukunft spielt, in der die Erde durch menschliche Experimente mit genetisch veränderten Pflanzen stark verändert wurde. Der Wald, der nun einen Großteil des Planeten bedeckt, hat ein eigenes Bewusstsein entwickelt und kontrolliert die Umwelt. Die verbliebenen Menschen leben in einer fragilen Koexistenz mit dem Wald, der sowohl eine Bedrohung als auch eine Lebensgrundlage darstellt.

Der Protagonist, Agito, lebt in der Stadt Neutral City, einer der letzten menschlichen Siedlungen, die inmitten des Waldes existiert. Sein Leben ändert sich schlagartig, als er zufällig auf ein mysteriöses Mädchen namens Toola stößt, das aus einer kryogenen Kammer tief im Wald befreit wird. Toola stammt aus der Zeit vor der Katastrophe und trägt ein Gerät bei sich, das die Macht besitzt, den Wald zu zerstören und die Erde wieder in ihren ursprünglichen Zustand zu versetzen. Dies weckt das Interesse verschiedener Fraktionen, darunter die militaristische Gruppe Ragna, die das Gerät für ihre eigenen Ziele nutzen will.

Agito und Toola werden in einen Konflikt zwischen den Bewohnern von Neutral City, die den Wald respektieren und mit ihm leben, und den aggressiven Kräften von Ragna gezogen, die den Wald vernichten wollen, um die alte Zivilisation wiederherzustellen. Während ihrer Reise erfahren sie mehr über die Vergangenheit der Erde, die Ursprünge des Waldes und die wahren Absichten hinter Toolas Gerät. Agito muss sich zwischen der Bewahrung des Waldes und der Erfüllung von Toolas Wunsch, die Welt zu verändern, entscheiden.

Der Film thematisiert die Beziehung zwischen Mensch und Natur, die Folgen von Umweltzerstörung und die moralischen Dilemmata, die entstehen, wenn Technologie und natürliche Ökosysteme aufeinandertreffen. Die Charaktere, darunter Agitos Freundin Cain und der Anführer von Ragna, Shunack, verkörpern unterschiedliche Perspektiven auf diese Konflikte und tragen zur Komplexität der Handlung bei. "Origin ~Spirits of the Past~" bietet eine dichte Erzählung, die sowohl actionreiche Szenen als auch nachdenkliche Momente über die Zukunft der Menschheit und des Planeten vereint.