"Professor Pain" (OVA) handelt von einem mysteriösen Wissenschaftler, der als Professor Pain bekannt ist. Er ist ein brillanter, aber zwielichtiger Forscher, der sich auf die Erforschung von Schmerz und dessen Auswirkungen auf den menschlichen Körper und Geist spezialisiert hat. Die Handlung dreht sich um seine Experimente, bei denen er Freiwillige und unfreiwillige Probanden extremen Schmerzreizen aussetzt, um die Grenzen der menschlichen Ausdauer und die psychologischen Folgen von Schmerz zu erforschen.

Die Hauptfigur, Professor Pain, wird als kalter und berechnender Charakter dargestellt, der von einer obsessiven Neugier getrieben wird. Seine Experimente sind oft grausam und unmenschlich, doch er rechtfertigt sie mit dem Ziel, wissenschaftliche Erkenntnisse zu gewinnen, die die Menschheit voranbringen könnten. Im Laufe der Geschichte wird deutlich, dass seine Methoden jedoch zunehmend fragwürdig und gefährlich werden.

Ein weiterer zentraler Charakter ist eine junge Frau, die unfreiwillig in eines seiner Experimente gerät. Sie wird zur Protagonistin, die gegen die unmenschlichen Bedingungen und die psychische Belastung kämpft, während sie versucht, sich aus der Kontrolle des Professors zu befreien. Ihre Entwicklung von einer hilflosen Opferfigur zu einer entschlossenen Kämpferin bildet einen wichtigen Handlungsstrang.

Die Handlung ist düster und konfrontiert den Zuschauer mit ethischen Fragen über die Grenzen der Wissenschaft und die Moral von Experimenten am Menschen. Die OVA zeigt eine Welt, in der die Suche nach Wissen oft auf Kosten der Menschlichkeit geht, und stellt die Zuschauer vor die Frage, wie weit Wissenschaftler gehen dürfen, um Fortschritt zu erreichen.