Dokter Z, in japanischen Medien als Dokter Sonoida bekannt, ist der Hauptantagonist des ersten Handlungsbogens. Ursprünglich aus dem Jahr 2126 stammend, adoptierte er in seiner Vergangenheit das Alpha-Trio – Ursula, Zander und Ed – und wurde Vater von Rod und Laura, nachdem er sie aus einem Waisenhaus geholt hatte. Er zog sie alle ohne eine registrierte Ehe auf, was eine freundlichere Seite seines Charakters zeigte.

Seine Geschichte beginnt mit Dr. Ancients Mission, Dinosaurier durch Zeitreisen aus dem Mesozoikum zu retten. Als er am Weihnachtstag 2127 aufbrach, manipulierte Dokter Z heimlich die gesammelten Dinosaurier für Kampfzwecke, entwickelte im Geheimen Move-Karten und züchtete mächtige „Geheim-Dinosaurier“. Während des Rückflugs in die Zukunft sabotierte er den Kurs des Zeitschiffs, wodurch es in der Gegenwart abstürzte und Dinosaurierkarten weltweit verstreut wurden. Dieser Absturz strandete auch den kleinen Rex und seinen Beschützer Jonathan zwölf Jahre früher.

Von der künstlichen Insel Zeta Point (später als das getarnte Zeitschiff Backlander entlarvt) aus operierend, übertrug er Feldmissionen meist dem Alpha-Trio, während er sich auf Erfindungen, Kartenforschung und die frühe Erkennung von Karten mittels Dinosaurierknochen-Gesängen konzentrierte. Seine technischen Kreationen stellten Fahrzeuge und Ausrüstung für die Alpha-Gang bereit, die jedoch oft defekt waren oder nur einmalig nutzbar. Obwohl er die Roboter-Haushälterin Helga aus einem Zukunftsset baute, fehlte ihm das Programmierwissen, um ihre Fehlfunktionen zu beheben.

Sein Charakter zeigt extremes Ego, eine kurze Zündschnur, Sturheit und die Weigerung, Schuld einzugestehen. Er ist auch geizig und besitzergreifend, beansprucht gewünschte Objekte und vermeidet unnötige Ausgaben. Versuche, Autorität über Helga zu behaupten, werden von ihrem strengen Blick leicht unterbunden. Spuren seiner früheren Güte zeigen sich bei Begegnungen mit seinen Geheim-Dinosauriern – die er selbst aufgezogen hat, manchmal schlecht – und wenn seine Enkel Rod oder Laura in Gefahr sind, obwohl seine erhofften freudigen Wiedersehen mit den Dinosauriern meist damit enden, dass diese fliehen oder ihn angreifen.

Wichtige Feldmissionen umfassten die Rückholung seiner Geheim-Dinosaurier (Folgen 14, 28, 34), die Sicherung des Dinomond-Bernsteins in New York und die Konfrontation mit Doppelgängern der Alpha-Gang. Gelegentlich beschwor er selbst Dinosaurier, bevorzugte Terry (Tyrannosaurus) oder Spiny (Spinosaurus). Eine Rückenverletzung durch das Heben von Alpha-Metall-Erz setzte ihn kurzzeitig außer Gefecht, doch schloss er sich nach seiner Genesung der Kyoto-Mission an, angeblich um die letzte Dinosaurierkarte zu finden.

Das Finale der ersten Staffel enthüllte seinen Aufstand gegen Dr. Ancient und Dr. Cretacia (Rex’ Eltern). Aus Angst, von der Mission entfernt zu werden, stieß er ihre Kapseln während des Flugs aus, was zum Absturz beitrug. Später verriet ihn sein Kamerad Seth zuerst und warf ihn von Zeta Point. Dies zwang ihn, sich mit dem D-Team gegen Seths Bedrohung durch den schwarzen T-Rex in Sanjo City zu verbünden. Nachdem Rex ihn vor dem Dinosaurier rettete, entschuldigte er sich für die Schädigung von Rex’ Eltern – sein erster Akt der Reue. Er half dabei, Terry, Saurophaganax und Daspletosaurus zu beschwören, um gegen den schwarzen T-Rex zu kämpfen, und versuchte, Pachycephalosaurus zu reiten, wurde jedoch abgeworfen und vom Alpha-Trio gerettet. Nach dem Sieg wurden Dr. Ancient und Dr. Cretacia in Stasis an Bord der Backlander gefunden, möglicherweise von ihm aus versteckter Schuld vor dem Absturz gerettet.

In der zweiten Staffel kehrte er zunächst im Kreidezeitalter zum Antagonismus zurück, indem er Terry einsetzte, um wilde Dinosaurier anzugreifen. Nachdem er sich dem D-Team gegen die Spektralen Raum-Piraten anschloss, leistete er strategische Beiträge: Entwicklung von Gegenmitteln zur Spektralrüstung, Erstellung verbesserter Move-Karten und Erfindung von Element-Boostern, die DinoTector-Rüstungen ermöglichten. Seine Aktivitäten erstreckten sich über historische Epochen:
- Im alten Rom analysierte er Torvosaurus’ Spektralrüstung und setzte neue Technologie ein.
- In der Karibik half er gegen Gabbros Dinosaurier, nahm eine „Weißbart“-Piratenrolle auf dem Alpha-Piratenschiff ein und forderte den Titel während Seeschlachten.
- Im alten China litt er unter Zeitreisekrankheit, jagte Dinosaurier und gab wiederholt vor, Sanzo Hoshis Gruppe anzugehören, was nach gescheiterten Versuchen, die Frucht des ewigen Lebens zu ernten, zu Dorfverweisen führte.
- Im alten Persien führte Diebstahl von Schätzen zur Gefangennahme durch die 40 Diebe, Inhaftierung als Druckmittel gegen das Alpha-Trio und schließlich Rettung durch Aladdin.
Seine Rolle schwand in späteren Folgen, oft blieb er an Bord der Backlander oder delegierte Aufgaben, während er Nebenaktionen überwachte.

Dokter Z