Dunkle Materie tritt als primärer Antagonist auf, gegen den Yuuto Matsubara und Ai in vergangenen Kämpfen mit ihrem Time-Driver-Roboter gekämpft haben. Diese Konflikte spielten sich in ihren einfacheren, vor-erwachsenen Jahren ab. Die Entität manifestiert ungelöste emotionale Konflikte, die in Yuutos erwachsener Desillusionierung verwurzelt sind. Als 27-jähriger Angestellter einer Spielzeugfirma erträgt Yuuto eine anhaltende Leere, die vom Aufgeben seiner Träume und der kindlichen Romanze mit Ai herrührt. Dunkle Materie kehrt zurück, zusammen mit dem Auftauchen von Yuutos 12-jährigem Ich und dem Time Driver, und zwingt ihn, unterdrückte Probleme zu konfrontieren. Diese Macht verkörpert die Konsequenzen vernachlässigter Ambitionen und Beziehungen und bedroht direkt die Zukunft der Protagonisten, wenn sie ignoriert wird. Der Kampf gegen die Dunkle Materie dient als narrative Katalysator für Yuutos Auseinandersetzung mit seiner emotionalen Stagnation und seinem ungenutzten Potenzial.

Dark Matter