Junpei Iori besucht die Gekkoukan High School als Kernmitglied des Specialized Extracurricular Execution Squad (SEES). Anfangs verbirgt er tiefe Unsicherheiten aus seinem schwierigen Familienleben mit einem alkoholkranken Vater hinter der Fassade eines albernen, perversen Klassenclowns, der sich auf Humor und Prahlereien verlässt. Dies äußert sich in rücksichtslosem, unreifem Verhalten, einschließlich impulsiver Verfolgungen von Shadows ohne Rücksicht auf Konsequenzen. Er vernachlässigt sein Studium und priorisiert SEES-Aktivitäten, um sein Selbstwertgefühl zu stärken, gerät häufig mit Teammitglied Yukari Takeba aneinander, die ihn aufgrund seiner schlechten Entscheidungen und schulischen Leistungen „Stupei“ nennt.

Seine Motivation, SEES beizutreten, ist egoistisch, angetrieben vom Wunsch nach heldenhafter Anerkennung und Groll darüber, dass ihre Bemühungen unbekannt bleiben. Er beneidet den Protagonisten um dessen Führungsrolle und Wild Card-Fähigkeiten und macht gelegentlich sexistische Bemerkungen darüber, Befehle von weiblichen Teammitgliedern entgegenzunehmen. Diese Eifersucht führt zu wettbewerbsorientierten Ausbrüchen, da er den Kampf – in dem er ein Zweihandschwert wie einen Baseballschläger schwingt, unterstützt von seinem initialen, feuerbegabten Persona Hermes – als sein einziges Gebiet der Exzellenz betrachtet.

Ein entscheidender Wandel vollzieht sich durch seine Beziehung zu Chidori Yoshino, einem Mitglied der antagonistischen Gruppe Strega. Ihre Bindung schafft Konflikte für Chidori, die zwischen Strega und Junpei hin- und hergerissen ist. Als Strega-Anführer Takaya Sakaki Junpei tödlich verletzt, opfert Chidori ihr Leben und nutzt ihr Persona Medea, um ihn wiederzubeleben. Diese Tat vereint ihre Personas, verwandelt seines in Trismegistus und verleiht ihm regenerative Fähigkeiten. Chidoris Tod lässt Junpei tief reifen; er legt egoistische Motive ab, verpflichtet sich zur Selbstverbesserung und vertieft sein Engagement für SEES. Er trägt einen dolchförmigen Anhänger von Chidori als Andenken.

Während der Ereignisse von *Persona 3 The Movie: #4 Winter of Rebirth* stellt sich Junpei gemeinsam mit SEES der bevorstehenden Ankunft von Nyx. Nachdem er sich weigert, Nyx‘ Boten Ryoji Mochizuki zu töten, beteiligt er sich am Angriff auf Tartarus. Er bekämpft Strega-Mitglieder und Shadows, um Nyx zu erreichen, und unterstützt den Protagonisten im finalen Kampf. Nach Nyx‘ Niederlage verliert er die Erinnerungen an die Dark Hour, erinnert sich später jedoch an das Versprechen der Gruppe, sich auf dem Schuldach wieder zu treffen, und erscheint dort, um ihren Pakt zu erfüllen.

In späteren Auftritten wie *Persona 4 Arena Ultimax* dient der 19-jährige Junpei als Reservemitglied der Shadow Operatives. Er trainiert ein Little-League-Baseballteam, was seine anhaltende Leidenschaft für den Sport widerspiegelt. Im Kampf behält er Trismegistus bei und nutzt einen Baseballschläger mit einem Moveset, das seinen Fähigkeiten aus Persona 3 entspricht. Sein Design zeigt längere Haare, eine rückwärts getragene Kappe und Chidoris Anhänger, was ihren bleibenden Einfluss unterstreicht.

Junpei Iori