Kommandant Kagisu bekleidet einen hohen Rang in der Ost-Autonomie-Armee, die hauptsächlich auf der Sentan-Insel stationiert ist. Er ist groß gewachsen, hat helle Haut, scharfe blaue Augen und kurzes dunkles Haar, das an den Seiten rasiert ist, sowie ein markantes Muttermal unter dem rechten Auge. Er trägt stets seine Militäruniform aus seinem vorherigen Dienst in Barador.

Während dieses Einsatzes in Barador geriet Kagisu in tödliche Gefahr und wurde von Ryuzo Takehara gerettet. Dieses Ereignis gewinnt später an Bedeutung, als er erfährt, dass Ryuzos Sohn, Akiyuki Takehara, nach einer Busexplosion auf der Sentan-Insel vermisst wird. Als Kagisu den gemeinsamen Nachnamen erkennt, stellt er die Verbindung zwischen Akiyuki und seinem Retter her und arrangiert über seine Sekretärin Prois Sukkaki ein Treffen mit Ryuzo, das dieser jedoch nicht wahrnimmt.

Kagisu leitet militärische Operationen im Zusammenhang mit Xam'd und der Forschung an Humanform-Waffen. Er beobachtet einen in Stein eingeschlossenen, inaktiven Xam'd unter der Aufsicht von Dr. Kanba. Als Dr. Kanba enthüllt, dass er ohne Genehmigung Experimente durchgeführt hat, bei denen Freiwillige, darunter die Studentin Shidara, mit Hiruko injiziert wurden, reagiert Kagisu wütend. Trotz Kagisus Einwänden rechtfertigt Dr. Kanba die Handlungen als kriegsnotwendig. Später wird Kagisu entsandt, um Shidara zu stoppen, nachdem sie sich in eine rasende Humanform-Waffe verwandelt hat. Nachdem ein ASP-Nutzer sie außer Gefecht gesetzt hat, exekutiert er sie persönlich und erinnert sich an Dr. Kanbas Aussage, dass sie unabhängig von ihrer Wahl dazu verdammt seien, Kriegsverbrecher zu sein.

Seine Befehlsentscheidungen betonen utilitaristische Prioritäten. Während des Erwachens des Test-Typ-Xam'd auf dem Militärübungsgelände ordnet er an, die Sicherheit der Zivilisten als oberste Priorität zu behandeln, und weist die Rekruten an, die Kreatur zu eliminieren. Nach dem Erfolg des Rekruten Furuichi Teraoka rekrutiert er ihn und Haru Nishimura für eine Mission zum Tsumebara-Pass. Dort enthüllt er, dass das eigentliche Ziel die Sicherung eines seltenen grünen Seelensteins ist, nicht die Lokalisierung einer vermissten ASP-Einheit. Später informiert Furuichi ihn, dass Akiyuki sich mit Raigyo Tsunomata verbündet und zu einem Xam'd geworden ist.

Kagisu kämpft mit Schuldgefühlen und Desillusionierung aufgrund seiner Kriegshandlungen. Er äußert den Wunsch, sein Leiden zu beenden, und fragt Ryuzo, ob er bereit sei, ihn zu töten. Als Ryuzo sich weigert, versucht Kagisu, sich selbst mit einem Schuss zu töten. Ryuzo greift ein, leistet lebensrettende medizinische Hilfe und beschäftigt Kagisu später als Haushälter in seiner Klinik, was ihre komplexe Beziehung widerspiegelt, die auf Schuld und Reue basiert.

Kagisu unterhält eine angespannte familiäre Beziehung. Er bezeichnet seine Mutter, Sumako Kagisu, als verstorben, obwohl sie noch lebt. Die Natur ihrer Beziehung und seine Gründe, ihre Existenz zu leugnen, bleiben unerforscht.

Toujirou Kagisu