Sophitia bewahrt eine hilfsbereite, mütterliche Fassade als Bibliothekarin der Granseed-Akademie und verbirgt ihre wahre Rolle als Anführerin von Physis – eines Kultes, der der Verbreitung von Zerstörung und der Wiedererweckung der bösen Göttin Nestra gewidmet ist. Sie manipuliert heimlich Akademieereignisse und Personen im Sinne der Ziele des Kultes. Ihr Hintergrund hängt mit der Erschaffung von Nemo zusammen, eines Homunculus, der unter Amis Germain als "Sohn der Zerstörung" konzipiert wurde. Sie orchestriert Nemos Flucht und seine Annahme der Identität und Erinnerungen eines menschlichen Jungen. Später nutzt sie Gareths Trauma über die Zerstörung seines Clans durch Physis aus, indem sie ihm falsche Informationen über Nemos Ursprung und eine Bedrohung in der alten Bibliothek von Granseed zuspielt. Als versiegelte dunkle Macht eine globale Katastrophe droht, korrumpiert sie Gareth, indem sie seine Fähigkeiten verstärkt, um Nemo zu töten, und macht so seine Wut und Schuld zur Waffe.

Als wahre Antagonistin plant Sophitia die Wiederkehr von Physis und die Verbreitung der Zerstörung, mit dem Ziel, die versiegelte dunkle Macht der Akademie zu entfesseln. Während des finalen Konflikts durchläuft sie eine groteske Metamorphose zu einem monströsen "Schwangeren Eiter-Titanen", verkörpert die zerstörerische Kraft, der sie dient, und gipfelt in ihren Bemühungen, die Vernichtung zu kanalisieren. Ihre Manipulationen umfassen den Versuch, Gareth zu beseitigen, nachdem sein Nutzen erschöpft ist, obwohl er durch seine Dunkelheitskräfte überlebt. Im Höhepunkt kämpft sie gegen Nemo und Faria. Nemo nimmt seine wahre Gestalt und das Vermächtnis von Jenius und dem ursprünglichen Nemo an, vereint ihre verbliebene Kraft, um das Buch der Zeit neu zu erschaffen. Diese Handlung fängt Sophitia und die dunklen Mächte im Buch ein, versiegelt ihre Bedrohung dauerhaft, allerdings um den Preis, dass Jenius' Seele und Nemos Kräfte erlöschen.

Sophitia