Vor dem Second Impact war Kohzou Fuyutsuki Professor für metaphysische Biologie an der Universität Kyoto. Dort betreute er Yui Ikari und entwickelte eine bedeutende akademische und persönliche Bindung zu ihr. Seine erste Begegnung mit Gendo Rokubungi (später Gendo Ikari) bestand darin, Gendo nach einer Schlägerei in einer Bar aus dem Polizeigewahrsam zu holen – eine Handlung, die sofort Fuyutsukis Misstrauen weckte. Dieses Misstrauen vertiefte sich, als er von Yuis romantischer Beziehung zu Gendo erfuhr, einer Verbindung, die Fuyutsuki privat ablehnte, obwohl er nach außen hin professionell blieb.

Nachdem der Second Impact seine akademische Laufbahn beendet hatte, arbeitete Fuyutsuki während der postkatastrophalen Knappheit als Arzt ohne Lizenz in Toyohashi. Später schloss er sich einer UN-Expedition in die Antarktis an, wo er Beweise entdeckte, die Gendo und SEELE mit der Katastrophe in Verbindung brachten. Als er Gendo mit seinen Erkenntnissen konfrontierte, wurde ihm das unterirdische GeoFront und der Prototyp des Evangelion Unit-00 gezeigt. Angesichts der drohenden Eliminierung durch SEELE wegen seines Wissens schloss er sich aus Notwendigkeit Gendos Organisation Gehirn (später NERV) an.

Als stellvertretender Kommandeur von NERV wurde Fuyutsuki Gendos engster Vertrauter und leitete die Operationen in dessen Abwesenheit. Trotz seiner persönlichen Abneigung gegen Gendo blieb er loyal, teilweise motiviert durch ihr gemeinsames Ziel, Yui wiederzusehen, deren Bewusstsein in Evangelion Unit-01 residierte. Fuyutsuki war über SEELEs Human Instrumentality Project und Gendos abweichende Pläne informiert und fungierte oft als pragmatisches Gegengewicht zu Gendos Rücksichtslosigkeit.

Während der Ereignisse von "Thrice Upon a Time" unterstützte Fuyutsuki Gendo beim Neustart von Evangelion Unit-13, um den "Additional Impact" auszulösen. Er befehligte die Nemesis-Serie (04-Serie) der Evangelions, um WILLE zu testen und zu bekämpfen, und überwachte taktische Einsätze, darunter Angriffe auf WILLEs Flaggschiff, die Wunder. Seine Handlungen gipfelten in der Unterstützung von Gendos Konfrontation mit Shinji Ikari im Anti-Universum und Gendos letztem Plan, die Instrumentality zu nutzen, um die Welt zurückzusetzen und der Menschheit ein Leben ohne Evangelions zu ermöglichen. Fuyutsukis Schicksal nach diesem Reset bleibt ungeklärt.

In den Rebuild-Filmen bewahrte Fuyutsuki seinen charakteristischen Stoizismus und trockenen Witz. Seine Motivationen waren stets eine Mischung aus Pflichtgefühl, Überlebenswillen und anhaltender Hingabe zu Yuis Vermächtnis, obwohl er nur minimalen direkten Kontakt mit Charakteren wie den Piloten hatte.

Kohzou Fuyutsuki