Kei Amemiya, eine ehemalige 17–18-jährige Aktivistin der linksterroristischen Gruppe Sect in einem alternativen Nachkriegs-Japan, entging zunächst als Kurierin dem Verdacht, indem sie ihre kindliche Unschuld ausnutzte, und erhielt den Codenamen "Rotkäppchen" für den Transport von Sprengstoff. Nach ihrer Ergreifung durch die Öffentliche Sicherheit der Metropolitan Police wird sie gezwungen, unter einer falschen Identität als ältere Schwester von Nanami Agawa – einer verstorbenen Sect-Kurierin, die während eines Zusammenstoßes mit dem Kerberos-Mitglied Kazuki Fuse Suizid beging – in die Reihen von Kerberos einzudringen. Die Öffentliche Sicherheit instrumentalisiert diese erfundene Verwandtschaft, um Fuses Schuldgefühle auszunutzen, und positioniert Kei als Bauern, um ihn in eine Falle zu locken.

Ihre Mission gerät ins Wanken, als ein zufälliges Treffen an Nanamis Grab eine unerwartete Bindung zu Fuse entfacht. Was als kalkulierte Manipulation beginnt, vertieft sich allmählich zu echten emotionalen Bindungen, die mit ihrer erzwungenen Rolle in der Verschwörung kollidieren. Als der Plan der Öffentlichen Sicherheit Gestalt annimmt, wird Kei als Köder in einem inszenierten Museumshinterhalt benutzt, um Fuse zu beschuldigen und Kerberos zu zerschlagen. Fuse rettet sie, und ihre Flucht führt sie in die Kanalisation, wo die geheime Jin-Roh-Einheit von Kerberos sie abfängt. Die Jin-Roh-Agenten enthüllen ihr Wissen über Keis Beteiligung und nutzen ihr Überleben, um den Plan der Öffentlichen Sicherheit aufzudecken.

In die Enge getrieben und gejagt, steht Kei einer letzten Abrechnung gegenüber, als Jin-Roh Fuse befiehlt, sie zu exekutieren, um die Verschwörung auszulöschen. In ihren letzten Momenten zitiert sie das "Rotkäppchen"-Märchen und erkennt Fuses paradoxe Rolle als sowohl ihr Beschützer als auch ihr Henker an. Ihr Tod wird zum Katalysator, der den Kreislauf aus Manipulation und Tragik zementiert, der von institutionellen Rivalitäten, Loyalitäten und den persönlichen Kosten der Täuschung gewoben ist.

Kei Amemiya