Professor Koyanagi ist Tadashis Onkel, ein Wissenschaftler und Erfinder, der in einen Ausbruch mechanisierter Meereslebewesen verwickelt wird. Sein Vater starb an einem Herzinfarkt in einer Fabrik an einem heißen Sommertag; derselbe Mann entwickelte die ursprüngliche Technologie für mechanische Beine, die später an den infizierten Kreaturen gefunden wurde. Diese Technologie stammte aus Forschungen der Kaiserlich Japanischen Armee während des Zweiten Weltkriegs, die darauf abzielten, eine biologische Waffe mit einem Virus zu entwickeln, das einen tödlichen "Todesgestank" erzeugte.

Während er einen infizierten Fisch in seinem Labor untersucht, greifen die mechanischen Beine der Kreatur nach Koyanagis Arm. Er amputiert seinen eigenen Arm, um die Ausbreitung der Infektion zu stoppen. Trotz dieses Traumas bleibt er beunruhigend fasziniert von der Maschinerie und stellt seine wissenschaftliche Neugier über sein Wohlbefinden. Später konstruiert er eine maßgefertigte Laufmaschine und befestigt die infizierte Kaori daran. Während dieses Vorgangs erleidet er eine tödliche Wunde, als er von dem spinnenartigen Bein von Kaoris Laufmaschine erstochen wird.

Tödlich verwundet zieht sich Koyanagi in "Labor Nr. 2" zurück, die Fabrik, in der sein Vater starb. Dort verbindet er sich mit einer modifizierten, fortschrittlichen Version der mechanischen Beine. Diese neue Vorrichtung umfasst einen zeppelinartigen Luftballon und eine darunter angebrachte Einheit, die eine zweite Person tragen kann. In diesem verwandelten Zustand versucht er, Tadashi und Ms. Yoshiyama zu töten, möglicherweise getrieben von Eifersucht oder Wahnsinn, nachdem er eine romantische Beziehung zwischen ihnen vermutet. Nachdem der Angriff scheitert, entführt er Ms. Yoshiyama und fliegt mit ihr davon.

In der OVA-Adaption wird Koyanagi zum Antagonisten, indem er anstelle von Kaori einen infizierten Tadashi an eine maßgefertigte Laufmaschine befestigt. Diese Version zeigt seinen Abstieg in den Wahnsinn durch Experimente, der mit seinem Tod endet, als Tadashis Laufmaschine sich gegen ihn wendet.

Koyanagis letzter Auftritt im Manga zeigt, wie das Citrous Circus seiner Flugmaschine nachjagt und versucht, sie mit Gasgeschützen abzuschießen. Sie durchbohren den Ballon, doch seine Maschine entfaltet metallische Flügel, die ihm die Flucht mit der gefangenen Ms. Yoshiyama ermöglichen. Seine Rolle in der Anime-Adaption ist im Vergleich zum Manga stark reduziert, mit begrenzter Bildschirmzeit und einer geradlinigeren antagonistischen Funktion.

Professor Koyanagi