Shin Kusaka, Sohn des N1-Forschungszentrum-Wissenschaftlers Dr. Cromwell Collins, erhielt von seinem sterbenden Vater während eines Alien-Angriffs ein leuchtendes Amulett und das Codewort "Thundersub". Mit dem Auftrag, die N1-Einrichtung für das Überleben der Menschheit zu erreichen, führte Shin seine Mitschüler dorthin und traf unterwegs auf ein stummes Mädchen namens Anna. Im N1-Zentrum führte sie das Amulett zu einer versteckten Kammer, die das fortschrittliche Kriegsschiff Blue Noah beherbergte, das Shin durch Aussprechen des Codeworts aktivierte.

Als Teil der Crew der Blue Noah unter Kapitän Ei Domon diente Shin hauptsächlich auf dem Hilfs-U-Boot Tempest Jr. Er bewies seine Führungsqualitäten bei der Koordination von Missionen zur Rettung menschlicher Überlebender und Angriffen auf Alien-Stützpunkte. Seine Bindung zu Anna vertiefte sich, als er ihr half, ihr Trauma zu überwinden, was in einem entscheidenden Eingreifen gipfelte, das ihren katatonischen Zustand nach einem verheerenden Verlust brach.

Als Kapitän Domon im finalen Kampf gegen den Alien-Kommando-Satelliten Terror Star tödlich verwundet wurde, übernahm Shin das Kommando der Blue Noah. Er lenkte das Schiff erfolgreich, um die Kollision des Terror Star mit der Erde zu verhindern. Nach dem Konflikt heiratete Shin Anna und gründete mit ihr eine Organisation, die sich der planetaren Verteidigung gegen zukünftige außerirdische Bedrohungen widmet.

Shin Kusaka