Mamoru Kodate lebt als Schüler auf der Insel Tatsumiyajima und besucht die Schule zusammen mit Gleichaltrigen wie Kenji Kondou, Sakura Kaname und Karin Kuramae. Wenn Festum angreifen, evakuiert er mit seinen Klassenkameraden in einen Schutzraum und findet später sein Zuhause von neu errichteten Verteidigungswällen verdeckt vor. Sein Vater, Tamotsu Kodate, dient in der Verteidigungsorganisation der Insel, Alvis. Mamoru zeigt sich überrascht, als er erfährt, dass Karin einen Fafner pilotiert, und hinterfragt die Geheimhaltung seines Vaters. Mit Unglauben reagiert er, als Sakura vorschlägt, selbst zu pilotieren, und verweist auf das extreme Risiko.

Er nimmt an sozialen Aktivitäten teil, besucht ein Dojo mit Kenji und Sakura, wo Sakura beide besiegt. Tamotsu entdeckt, dass Mamoru Manga liest statt zu lernen, gibt sie ihm zurück, nachdem er nach der Handlung gefragt hat, und offenbart dann Mamorus Auswahl als Fafner-Pilot. Später schließt Mamoru sich Freunden für eine Führung durch eine Alvis-Einrichtung an, die in einem Gruppenfoto an einem Unterwasser-Observatorium gipfelt. Er ist einer von vier Kandidaten, die für das Fafner-Training ausgewählt werden, bevor ein Alarm ihre Einweisung unterbricht.

Im Kampf nimmt Mamoru die Identität „Goubain“ an, inspiriert von einem Manga-Charakter, dessen Helm er beim Piloten trägt. Diese alternative Persönlichkeit verkörpert furchtloses Selbstvertrauen, im Gegensatz zu seinem normalen Ich, und führt zu postkampflicher Amnesie bezüglich der Kampfgeschehnisse. Er pilotiert den Mark Funf, einen Fafner der ersten Generation vom Nothung-Modell, der mit erhöhter Resistenz gegen Festum-Assimilation entwickelt wurde. Sein Cockpit befindet sich im Schrittbereich mit einem Auswurfmechanismus für den Kontrollblock. Anfänglich auf waffenlosen Kampf beschränkt, setzt der Mark Funf später die Luger Lance für Nah- und Fernangriffe ein. Sein charakteristisches Aegis-Schild, auf der Schulter montiert, besteht aus vier Panelen, die Energieschilde entfalten, die physische und Wurmloch-Angriffe abwehren; diese Panelen feuern auch Energiegeschosse ab.

Als Goubain beweist Mamoru außergewöhnliche strategische Fähigkeiten und Kampfkunst. Schließlich entscheidet er sich, den Helm abzulegen. Seine Freundschaften bleiben zentral; er befragt Yukie Kariya nach dem Kampf, trotz ihrer Abweisung, und schließt sich Gleichaltrigen an, die Befehle missachten, um die Fenrir-Aktivierung des Mark Sechs zu beobachten. Mamoru stirbt, nachdem der Mark Funf schwere Kampfschäden erlitten hat. Sein Vermächtnis lebt durch spätere Piloten weiter; Hiroto Douma erbt den reparierten Mark Funf, übernimmt die Goubain-Persönlichkeit als „Goubain der Zweite“, und die Einheit wird schließlich von den Neo-UN-Streitkräften als Grundlage für den Mark Raison übernommen.

In späteren Serien erscheint Mamoru in Rückblenden und Gedenken. Ein Familienfoto, das Tamotsu hält, ist während der Hochzeit von Sakura und Kenji zu sehen. Er erscheint unter Verstorbenen, denen Kenji und Sui Kaburagi begegnen. Weitere Rückblenden zeigen ihn mit anderen Piloten der ersten Generation während einer Kindheitsszene im Schnee, die von höherem Personal beobachtet wird.

Mamoru Kodate