Musashi operiert gemeinsam mit Kojiro und Mauzi als Team Rocket und infiltriert das Forschungsteam, das von Dr. Zed bei der Biotope Company angestellt ist und den Wald von Okoya untersucht. Ihre verdeckte Präsenz innerhalb der Organisation ermöglicht es ihnen, Informationen über Zeds Aktivitäten und Motive zu sammeln. Team Rocket hält diskret ihre Tarnung innerhalb der Forschungsgruppe aufrecht, während sie die Ereignisse rund um Koko, Ash und Zarude beobachten.

Das Trio zeigt sichtbaren Schrecken, als es entdeckt, dass Dr. Zed für den Tod von Kokos menschlichen Eltern verantwortlich ist. Obwohl sie normalerweise darauf fokussiert sind, Pokémon zu stehlen, insbesondere Pikachu, zeigen sie in diesem Fall ethische Grenzen auf und wechseln von selbstsüchtigem Opportunismus dazu, Gerechtigkeit gegen Zed zu ermöglichen.

In einem kritischen Moment, als Ash und Pikachu von Zed gefangen genommen werden, orchestriert Team Rocket gezielt Pikachus Befreiung aus dem Gewahrsam. Diese Entscheidung ist strategisch, da sie erkennen, dass die Freilassung von Pikachu die Möglichkeit schafft, eine Keycard zu beschaffen, die für den Zugang zu gesperrten Bereichen in Zeds Operationen benötigt wird. Sie priorisieren diesen taktischen Vorteil gegenüber einer sofortigen Chance, Pikachu zu fangen, in der Berechnung, dass sich zukünftige Gelegenheiten zum Stehlen des Pokémon ergeben werden.

Nach Dr. Zeds Niederlage liefert Team Rocket anonym belastendes Beweismaterial über seine Verbrechen an die Behörden. Diese Aktion führt direkt zu Zeds Verhaftung und anschließender Inhaftierung. Ihre Entscheidung, Zed aufzudecken, obwohl sie keinen greifbaren Vorteil daraus ziehen und außerhalb ihrer üblichen kriminellen Ziele handeln, unterstreicht ihre Ablehnung seiner extremen Handlungen gegen Menschen und Pokémon.

Musashi