Jessie agiert neben James und Mauzi als Team Rocket, mit dem Ziel, Arceus zu fangen und den Juwel des Lebens für ihre Organisation an sich zu reißen. Sie wird Zeugin von Arceus' dramatischem Auftritt und der daraus resultierenden Verwüstung in den Ruinen von Michina. Inmitten der Zerstörung nach Arceus' Angriff entdeckt Jessie den echten Juwel des Lebens, versteckt in Marcus' Stab, und erkennt ihn, nachdem sie erfahren hat, dass Sheena eine Fälschung bei sich trug.

Team Rocket schmiedet einen Plan, um sowohl Arceus als auch den echten Juwel zu stehlen, und nennt ihr Vorhaben die "Freude der doppelten Beute." Ihr Versuch wird abrupt gestoppt, als Arceus die Ruinen zerstört, wodurch Jessi, James und Mauzi in den Fluss darunter stürzen und ihr unmittelbarer Plan vereitelt wird. Nachdem Ash und seine Freunde erfolgreich in der Vergangenheit eingegriffen haben, führt die veränderte Zeitlinie dazu, dass der echte Juwel des Lebens in der Gegenwart aus dem Besitz von Team Rocket verschwindet.

Unabhängig von der Jagd nach dem Juwel versuchen Jessi, James und Mauzi, Wassermelonen zu stehlen, was ihre früheren komischen Missgeschicke widerspiegelt. Jessi reagiert auch begeistert, als sie Dialga und Palkia neben Sheena auftauchen sieht, und zeigt ihre Ehrfurcht vor den legendären Pokémon und ihren Fähigkeiten, obwohl ihr Fokus fest darauf gerichtet bleibt, die Situation für die Ziele von Team Rocket zu nutzen.

Jessie