Jacob ist der Direktor von E=X, der Organisation, die für die Sicherheit von Eden verantwortlich ist. Er rekrutiert den Hacker Eiji Takanaka aufgrund dessen außergewöhnlicher Fähigkeiten im virtuellen Realitätsspiel "Hard On", da er Eijis Potenzial erkennt, die transformierbaren Garland-Einheiten gegen Netjacker zu steuern. Als Eijis Vorgesetzter weist er ihm Missionen zu, die auf den Widerstand der Netjacker abzielen.

Seine umstrittenen Handlungen eskalieren, als er während einer Operation die Kontrolle über Eijis Geist übernimmt und versucht, ihn dazu zu zwingen, den Netjacker-Anführer Sion zu töten. Dieser Übergriff löst direkt Eijis Abfall von E=X zu den Netjackern aus. Jacob wird daraufhin zu einem Hauptantagonisten, der absolute Loyalität zum herrschenden "System" von Eden demonstriert.

Später gerät Jacob mit Edens spirituellem Führer, Bischof Won Dai, in Konflikt um die Kontrolle über das System, da er Won Dais Projekt Himmel als widersprüchlich zu den Systemdirektiven ablehnt. Dieser Konflikt gipfelt darin, dass Jacob eine Garland-Einheit gegen sowohl Eiji als auch Won Dais Truppen steuert. Sein Engagement treibt ihn dazu, Eiji bis in die unteren Ebenen Edens zu verfolgen, was zu einem finalen Kampf führt, in dem Jacob besiegt wird. Jacobs Hintergrund vor seiner Zeit bei E=X bleibt undokumentiert; seine Entwicklung konzentriert sich ausschließlich auf seinen Wandel von einer Autoritätsfigur zum Antagonisten durch die zunehmende Durchsetzung der Autorität des Systems.

Jacob