"Z/X Code Reunion" ist ein Manga, der in einer Welt spielt, in der fünf verschiedene Dimensionen, bekannt als Schwarz, Rot, Blau, Weiß und Grün, miteinander kollidieren. Diese Dimensionen werden von mächtigen Wesen, den sogenannten "Z/X", bewohnt, die in die menschliche Welt eindringen und dort Konflikte auslösen. Die Handlung konzentriert sich auf eine Gruppe von Mädchen, die an der Akademie für Z/X-Kämpferinnen ausgebildet werden, um gegen diese Bedrohung zu kämpfen.

Die Protagonistin, Ayase Amane, ist eine junge Frau, die aufgrund eines traumatischen Ereignisses in ihrer Vergangenheit zunächst zögerlich ist, sich dem Kampf anzuschließen. Sie wird jedoch von ihrer Freundin und Klassenkameradin, Azumi Kagamihara, ermutigt, ihre Ängste zu überwinden. Zusammen mit weiteren Mitschülerinnen wie Yuni, El und Chitose bilden sie ein Team, das sich den Herausforderungen stellt, die die Z/X mit sich bringen.

Die Handlung entwickelt sich um die Ausbildung der Mädchen, ihre persönlichen Entwicklungen und die Beziehungen untereinander. Dabei werden sowohl die Kämpfe gegen die Z/X als auch die internen Konflikte innerhalb der Gruppe thematisiert. Die Charaktereigenschaften und Hintergründe der Mädchen werden nach und nach enthüllt, was zu einer Vertiefung der Handlung und der zwischenmenschlichen Dynamiken führt.

Ein zentrales Element der Geschichte ist die Verbindung zwischen den Mädchen und ihren jeweiligen Z/X-Partnern, die ihnen im Kampf zur Seite stehen. Diese Partnerschaften sind entscheidend für den Erfolg im Kampf gegen die Bedrohungen aus den anderen Dimensionen. Die Handlung kombiniert Action, Drama und humorvolle Momente, während sie die Herausforderungen des Erwachsenwerdens und der Teamarbeit in einer gefährlichen Welt beleuchtet.