"D Genesis: Dungeon ga Dekita 3-nen" ist eine Manga-Serie, die in einer Welt spielt, in der plötzlich Dungeons auftauchen und das Leben der Menschen grundlegend verändern. Die Handlung beginnt drei Jahre nach der Entstehung dieser Dungeons, die als mysteriöse, gefährliche Orte gelten, die jedoch auch wertvolle Ressourcen und seltene Gegenstände bergen. Die Dungeons ziehen Abenteurer, Unternehmen und Regierungen an, die alle versuchen, die Geheimnisse und Schätze dieser Orte zu ergründen.

Die Hauptfigur ist ein junger Mann namens Yoshimura, der in einer Firma arbeitet, die sich auf die Erforschung und Ausbeutung der Dungeons spezialisiert hat. Yoshimura ist jedoch kein typischer Abenteurer oder Kämpfer, sondern ein Büroangestellter, der sich mit der Verwaltung und Analyse von Dungeon-Daten beschäftigt. Seine Arbeit besteht darin, die komplexen Mechanismen und Risiken der Dungeons zu verstehen, um die Effizienz und Sicherheit der Expeditionen zu verbessern.

Im Laufe der Geschichte wird Yoshimura in eine Reihe von Ereignissen verwickelt, die ihn tiefer in die Geheimnisse der Dungeons führen. Er entdeckt, dass die Dungeons nicht nur physische Herausforderungen darstellen, sondern auch mit übernatürlichen Phänomenen und unerklärlichen Kräften verbunden sind. Dabei stößt er auf gefährliche Gegner, unerwartete Verbündete und Geheimnisse, die das Potenzial haben, die Welt, wie sie bekannt ist, zu verändern.

Die Serie kombiniert Elemente des Abenteuers, der Fantasy und des Mystery-Genres, wobei der Fokus auf der strategischen und analytischen Herangehensweise an die Dungeons liegt. Yoshimuras Charakterentwicklung steht im Mittelpunkt, da er sich von einem zurückhaltenden Büroangestellten zu einer Schlüsselfigur in der Erforschung der Dungeons entwickelt. Die Handlung wird durch eine Mischung aus Spannung, Rätseln und Action vorangetrieben, während gleichzeitig die sozialen und wirtschaftlichen Auswirkungen der Dungeons auf die Gesellschaft thematisiert werden.