"Unbreakable Machine Doll" ist eine Manga-Serie, die in einer Welt spielt, in der mechanische Puppen, sogenannte Automata, von Puppenspielern kontrolliert werden. Diese Puppen werden in einem Wettbewerb namens "Walpurgis Royal Academy of Machinart" eingesetzt, bei dem Puppenspieler und ihre Automata gegeneinander antreten, um ihre Fähigkeiten unter Beweis zu stellen. Die Handlung konzentriert sich auf Raishin Akabane, einen jungen Puppenspieler, der die Akademie besucht, um Rache für die Zerstörung seines Clans zu nehmen. Er wird von seiner Automata Yaya begleitet, einer humanoiden Puppe mit übernatürlichen Kräften und einer starken emotionalen Bindung zu Raishin.

Raishins Ziel ist es, den "Wiseman" zu besiegen, den Anführer der "Twilight Executors", einer Gruppe, die für den Untergang seines Clans verantwortlich ist. Um dies zu erreichen, muss er sich in den Kämpfen an der Akademie behaupten und gegen andere talentierte Puppenspieler antreten. Die Serie erkundet die Beziehung zwischen Raishin und Yaya, die trotz ihrer mechanischen Natur menschliche Emotionen zeigt, sowie die komplexen Dynamiken zwischen den verschiedenen Charakteren an der Akademie.

Die Handlung ist geprägt von intensiven Kämpfen, strategischen Manövern und der Entwicklung der Charaktere, die sich mit Themen wie Loyalität, Rache und der Natur von Menschlichkeit auseinandersetzen. Neben Raishin und Yaya spielen auch andere Puppenspieler und ihre Automata eine wichtige Rolle, darunter Charaktere wie Frey, eine mysteriöse Puppenspielerin mit eigenen verborgenen Motiven, und Shouko, eine ehemalige Klassenkameradin von Raishin. Die Serie verbindet Action, Drama und Fantasy-Elemente, während sie die moralischen und ethischen Fragen im Umgang mit künstlicher Intelligenz und menschlicher Emotionen untersucht.