"Bodacious Space Pirates: Abyss of Hyperspace" ist ein Manga, der im Science-Fiction-Genre angesiedelt ist und eine eigenständige Geschichte innerhalb des "Bodacious Space Pirates"-Franchises erzählt. Die Handlung spielt in einer fernen Zukunft, in der die Menschheit das All kolonisiert hat und Raumpiraterie zu einem regulierten und akzeptierten Beruf geworden ist. Der Fokus liegt auf Marika Kato, einer jungen Schülerin, die unerwartet zur Kapitänin des Raumschiffs Bentenmaru wird, nachdem ihr verstorbener Vater, der frühere Kapitän, sie als Nachfolgerin bestimmt hat.

Die Geschichte beginnt mit Marikas Alltag an der Hakuoh-Schule, einer Bildungseinrichtung für die Elite, die sich auf Raumfahrt und Handel spezialisiert hat. Als Kapitänin des Bentenmaru muss Marika jedoch regelmäßig ihre Pflichten als Piratin erfüllen, was sie in gefährliche und aufregende Abenteuer stürzt. Im Laufe der Handlung wird sie mit einer mysteriösen Bedrohung konfrontiert, die mit dem sogenannten "Abyss of Hyperspace" zusammenhängt, einem gefährlichen und unerforschten Bereich des Weltraums. Dieser Bereich birgt Geheimnisse, die sowohl für Marika als auch für die gesamte galaktische Gemeinschaft von großer Bedeutung sind.

Marika wird von einer vielfältigen Besatzung unterstützt, darunter die erfahrene Navigatorin Misa Grandwood, der technisch versierte Chiaki Kurihara und der mysteriöse Kane McDougal, der als Verbindung zur Piratenorganisation "Space Yacht Club" dient. Zusammen müssen sie nicht nur die Herausforderungen des Weltraums meistern, sondern auch politische Intrigen und die Machenschaften rivalisierender Gruppen aufdecken. Die Handlung verbindet Action, Abenteuer und strategische Raumschlachten mit Momenten der Charakterentwicklung, insbesondere im Hinblick auf Marikas Wachstum als Anführerin.

Ein zentrales Thema des Mangas ist die Balance zwischen Marikas Pflichten als Schülerin und ihrer Verantwortung als Piratenkapitänin. Dabei wird auch die Beziehung zwischen Mensch und Technologie sowie die Bedeutung von Vertrauen und Zusammenarbeit in einer gefährlichen und unberechenbaren Umgebung thematisiert. Der Manga bietet eine Mischung aus spannenden Weltraumszenarien und persönlichen Konflikten, die die Charaktere vorantreiben und die Handlung komplex gestalten.