"Cells at Work! Code Black" ist eine Anime-Serie, die in einem menschlichen Körper spielt, der durch ungesunde Lebensgewohnheiten stark belastet ist. Die Handlung konzentriert sich auf die Zellen, die in diesem geschädigten Körper arbeiten und ums Überleben kämpfen. Im Gegensatz zur ursprünglichen Serie "Cells at Work!" zeigt "Code Black" eine düstere und realistischere Darstellung der physiologischen Prozesse, die durch Stress, Krankheiten und schlechte Lebensbedingungen beeinträchtigt werden.

Die Protagonisten sind ein roter Blutkörperchen (AA2153) und ein weißes Blutkörperchen (U-1196), die in einem Körper arbeiten, der unter Alkoholmissbrauch, Rauchen, ungesunder Ernährung und anderen schädlichen Einflüssen leidet. AA2153 ist ein neu eingestellter Erythrozyt, der schnell mit den harten Realitäten des Körpers konfrontiert wird. U-1196 ist eine Neutrophile, die für die Bekämpfung von Krankheitserregern verantwortlich ist und oft in lebensbedrohliche Situationen gerät. Beide Charaktere müssen sich mit den Herausforderungen auseinandersetzen, die durch die geschwächte Gesundheit des Körpers entstehen.

Die Serie behandelt verschiedene medizinische und physiologische Themen, darunter die Auswirkungen von Arteriosklerose, Leberschäden, Haarausfall, sexueller Dysfunktion und Herzinfarkten. Jede Episode beleuchtet eine spezifische Gesundheitskrise, die durch den ungesunden Lebensstil des Körpers verursacht wird. Die Zellen müssen unter extremen Bedingungen arbeiten, oft mit begrenzten Ressourcen und unter ständiger Bedrohung durch Krankheitserreger oder den Zusammenbruch von Organen.

Die Handlung betont die Kämpfe und Opfer der Zellen, die trotz der widrigen Umstände versuchen, den Körper am Leben zu erhalten. Dabei werden auch ethische und moralische Fragen aufgeworfen, etwa wie weit die Zellen gehen sollten, um den Körper zu retten, und ob ihre Bemühungen angesichts der anhaltenden Schäden überhaupt sinnvoll sind. Die Serie bietet eine detaillierte und oft schonungslose Darstellung der Konsequenzen eines ungesunden Lebensstils, wobei die Zellen als metaphorische Arbeiter in einem zunehmend dysfunktionalen System agieren.