Yusei Fudo, der durch den Zero-Reverse-Vorfall, bei dem seine Eltern (die leitenden Entwickler des Ener-D-Projekts) ums Leben kamen, als Waise zurückblieb, wuchs in Satellite auf. Obwohl ihn Schuldgefühle als „Dunkelheit in seinem Herzen“ verfolgten, versicherten ihm Freunde wie Crow Hogan, dass er keine Verantwortung trug. Von seiner Pflegemutter Martha zusammen mit den anderen Waisen Jack Atlas und Crow Hogan aufgezogen, prägte diese Bindung seine selbstlose, beschützende Natur. Er setzt sich für Gemeinschaft ein, glaubt, dass niemand allein sein sollte, und ermutigt andere aktiv, Freundschaft zu akzeptieren.

Er hat eine gebräunte Haut, schwarze Haare mit goldenen Strähnen und blaue Augen. Sein charakteristisches Outfit besteht aus einer langärmeligen blauen Jacke mit bernsteinfarbenen Edelsteinen über einem ärmellosen schwarzen Shirt, edelsteinbesetzten Handschuhen, schwarzen Jeans mit Knieschützern und Motorradstiefeln. Auf der linken Seite seines Gesichts ist eine gezackte Verbrechermarke eingeätzt. Er trägt das Mal des Karmesinroten Drachen – zunächst den Drachenschwanz auf seinem Unterarm, später ersetzt durch den Drachenkopf nach dem Sieg über Rex Goodwin. Dieses Mal verleiht ihm Fähigkeiten wie das Aufspüren anderer Zeichen-Träger, das Errichten von Barrieren, Widerstand gegen Seelenabsorption oder historische Veränderungen, das Aktivieren des Ener-D-Reaktors seines Duel Runners, wenn andere versagen, und – mit der vollen Kraft des Karmesinroten Drachen – das Sehen oder Hören von Duellmonster-Geistern oder Zeitreisen.

Technisch versiert baute Yusei seinen Duel Runner, den Yusei Go, zweimal aus Schrottteilen, nachdem Jack Atlas den ersten zusammen mit Stardust Dragon gestohlen hatte. Als erfahrener Fahrer und geschickter Kämpfer, der Sicherheitsleute überwältigen kann, erstreckt sich sein strategischer Verstand auch auf Physik, was Akiza Izinski veranlasste, seine akademische Hilfe zu suchen. Später leitete er die Fortführung des Ener-D-Projekts und trat damit das Erbe seiner Eltern an. Als Kapitel von Team 5D glänzt er in Kampftaktiken und unterrichtet Turbo-Duellieren, wodurch er Akiza beim Erwerb ihrer Lizenz unterstützte.

Yusei duelliert sich mit einem Junk-Deck, das sich auf die Synchro-Beschwörung konzentriert. Seine Schlüsselkarte, Stardust Dragon, entwickelt sich mithilfe von „Majestic Dragon“ durch die Kraft des Karmesinroten Drachen zu Majestic Star Dragon und später zu Accel-Synchro-Monstern wie Shooting Star Dragon. Er beherrscht „Clear Mind“, um Ener-D bei kritischen Geschwindigkeiten zu kontrollieren, und ermöglicht so ab Episode 122 Accel-Synchro ohne den Karmesinroten Drachen. Schließlich erreicht er mit dessen Hilfe „Limit Over Accel Synchro“, beschwört Shooting Quasar Dragon, während sein Duel Runner sich gold färbt und fliegt. Er lehnt es ab, Karten als nutzlos zu bezeichnen, und hält Duellisten, die Karten als „Müll“ bezeichnen, des Titels für unwürdig – eine Haltung, die er nur lockert, wenn sie sich bessern, wie bei Bolt Tanner, den er später als „echten Duellisten“ anerkannte.

Im Konflikt mit dem zeitreisenden Antagonisten Paradox in *Yu-Gi-Oh! 3D: Bonds Beyond Time* verliert Yusei Stardust Dragon, als Paradox es mit einer leeren Karte während eines Turbo-Duells stiehlt. Der Diebstahl destabilisiert New Domino City, woraufhin der Karmesinrote Drache seinen Duel Runner für die Zeitreise verstärkt. In Jaden Yukis Zeitlinie angekommen, um ihn vor Paradox‘ korrumpierten Monstern, darunter Stardust Dragon, zu retten, erklärt Yusei die Bedrohung. Sie reisen weiter zurück in Yugi Mutos Ära, wo Paradox Maximillion Pegasus und andere getötet hat, um Duel Monsters auszulöschen. Der Karmesinrote Drache dreht die Zeit 30 Minuten zurück, sodass Yusei, Yugi und Jaden sich gegen Paradox vereinen können. Yusei argumentiert, dass die Veränderung der Geschichte die Zukunft der Menschen auslöscht, und konfrontiert Paradox‘ dystopische Motive. Ihre gemeinsamen Anstrengungen besiegen Paradox, stellen die Zeitlinien wieder her und bringen Stardust Dragon zurück.

In allen Medien bleibt Yusei standhaft („Fudō“) im Schutz anderer und der Stadt und schwört, einen weiteren Zero-Reverse-Vorfall selbst unter Einsatz seines Lebens zu verhindern. Seine Entschlossenheit gründet auf dem Glauben, dass Bindungen – nicht Schicksal – die Zukunft formen.

Yūsei Fudō