"Classroom of the Elite (Manga)" ist eine Adaption des gleichnamigen Light-Novel-Reihe und spielt in der fiktiven Koudo Ikusei Senior High School, einer Elite-Schule, die Schüler auf ihre zukünftigen Karrieren vorbereitet. Die Schule ist in vier Klassen unterteilt: Klasse A bis D, wobei Klasse A die höchste und Klasse D die niedrigste Stufe darstellt. Die Schüler werden basierend auf ihren akademischen und sozialen Fähigkeiten eingestuft, wobei Klasse D als Sammelbecken für diejenigen gilt, die als problematisch oder leistungsschwach angesehen werden.

Die Handlung konzentriert sich auf Kiyotaka Ayanokouji, einen scheinbar durchschnittlichen Schüler, der in Klasse D eingestuft wird. Ayanokouji wirkt zunächst unauffällig und distanziert, doch im Laufe der Geschichte wird deutlich, dass er über außergewöhnliche Intelligenz und Fähigkeiten verfügt, die er jedoch bewusst verbirgt. Seine wahre Natur und Vergangenheit bleiben lange Zeit ein Rätsel, das nach und nach enthüllt wird.

Die Schule führt regelmäßig spezielle Prüfungen und Wettbewerbe durch, bei denen die Klassen gegeneinander antreten. Diese Prüfungen testen nicht nur akademisches Wissen, sondern auch strategisches Denken, Teamarbeit und Manipulationsfähigkeiten. Die Schüler müssen sich in diesen Herausforderungen behaupten, um Punkte zu sammeln, die ihre Klassenposition verbessern können. Klasse D, angeführt von der ehrgeizigen Suzune Horikita und unterstützt von Ayanokouji, versucht, sich gegen die überlegenen Klassen A, B und C durchzusetzen.

Weitere wichtige Charaktere sind Kikyou Kushida, eine beliebte und scheinbar freundliche Schülerin, die jedoch ein dunkles Geheimnis verbirgt, und Ken Sudou, ein temperamentvoller Sportler, der oft in Konflikte gerät. Die Dynamik zwischen den Schülern ist geprägt von Rivalitäten, Freundschaften und Manipulationen, wobei jeder Charakter seine eigenen Motive und Hintergründe hat.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von Prüfungen und Konflikten, die die Schüler sowohl intellektuell als auch emotional herausfordern. Ayanokouji spielt oft eine zentrale Rolle, indem er im Hintergrund agiert und die Ereignisse manipuliert, um seine Ziele zu erreichen. Seine Beziehungen zu den anderen Schülern, insbesondere zu Horikita und Kushida, sind von strategischem Kalkül und gelegentlichen Momenten echter Verbundenheit geprägt.

"Classroom of the Elite (Manga)" bietet eine komplexe Erzählung, die Themen wie soziale Hierarchien, Machtspiele und die Natur des menschlichen Verhaltens erforscht. Die Geschichte bleibt spannend durch ihre unvorhersehbaren Wendungen und die tiefgründige Charakterentwicklung, die die Schüler in einem ständigen Kampf um Anerkennung und Überlegenheit zeigt.