"Nanbaka" spielt in einem der sichersten Gefängnisse der Welt, dem Nanba-Gefängnis, das für seine extremen Sicherheitsvorkehrungen bekannt ist. Die Handlung konzentriert sich auf vier Häftlinge, die im Gebäude 13 inhaftiert sind: Jyugo, Uno, Rock und Nico. Diese vier Insassen sind berüchtigt für ihre wiederholten Fluchtversuche, die jedoch stets scheitern. Jyugo, der Protagonist, trägt ein mysteriöses Schloss an seinen Handgelenken, das seine Hände gefesselt hält. Er wird von seinen Zellengenossen begleitet, die jeweils ihre eigenen einzigartigen Fähigkeiten und Persönlichkeiten besitzen. Uno ist ein Meister der Täuschung und des Glücksspiels, Rock ein kraftvoller Kämpfer mit einem sanften Herzen, und Nico ein Genie, das sich auf Chemie und Technologie spezialisiert hat.

Die Serie verbindet humorvolle Elemente mit ernsteren Handlungssträngen, wobei die Charaktere oft in absurde und komische Situationen geraten. Gleichzeitig wird die Hintergrundgeschichte von Jyugo und die Gründe für seine Inhaftierung allmählich enthüllt. Es wird deutlich, dass seine Fesseln mit einem dunklen Geheimnis verbunden sind, das seine Vergangenheit und seine Identität betrifft. Die Wärter des Gefängnisses, darunter Hajime Sugoroku, ein strenger und fähiger Aufseher, und sein Assistent Musashi, spielen eine wichtige Rolle bei der Überwachung der Häftlinge und der Verhinderung ihrer Fluchtversuche.

Im Laufe der Serie werden die Beziehungen zwischen den Häftlingen und den Wärtern vertieft, und es werden Konflikte sowohl innerhalb des Gefängnisses als auch mit externen Bedrohungen dargestellt. Die Handlung erforscht Themen wie Freundschaft, Loyalität und die Suche nach Freiheit, während die Charaktere mit ihren eigenen inneren Kämpfen und Vergangenheiten konfrontiert werden. "Nanbaka" bietet eine Mischung aus Action, Comedy und Drama, die durch die dynamischen Interaktionen der Figuren und die sich entfaltenden Geheimnisse des Nanba-Gefängnisses vorangetrieben wird.