"Gundam Frag" ist eine OVA, die in der "Mobile Suit Gundam"-Universum angesiedelt ist und eine eigenständige Geschichte erzählt. Die Handlung spielt in einer Zeit, in der Konflikte zwischen verschiedenen Fraktionen und Machtblöcken die Menschheit weiterhin spalten. Im Zentrum der Geschichte steht eine Gruppe von Piloten, die in einem abgelegenen Sektor des Weltraums stationiert ist. Diese Einheit, bestehend aus erfahrenen und unerfahrenen Soldaten, wird mit der Aufgabe betraut, eine mysteriöse Bedrohung zu untersuchen, die sich in Form von unbekannten mobilen Waffen manifestiert.

Die Protagonisten, darunter der junge und unerfahrene Pilot Kaito, die erfahrene Kommandantin Rena und der technisch versierte Mechaniker Hiro, müssen sich mit den Herausforderungen auseinandersetzen, die diese neuen Feinde darstellen. Die unbekannten mobilen Waffen, die als "Fragments" bezeichnet werden, scheinen über fortschrittliche Technologie zu verfügen und stellen eine ernsthafte Gefahr für die Menschheit dar. Im Laufe der Handlung wird deutlich, dass diese Fragments möglicherweise mit einem verlorenen oder vergessenen Projekt aus der Vergangenheit zusammenhängen, das außer Kontrolle geraten ist.

Die Charaktere müssen nicht nur gegen die äußere Bedrohung kämpfen, sondern auch mit internen Konflikten und persönlichen Herausforderungen umgehen. Kaito, der anfangs unsicher und von Selbstzweifeln geplagt ist, entwickelt sich im Laufe der Mission zu einem entscheidenden Mitglied des Teams. Rena, die als strenge und disziplinierte Führungspersönlichkeit dargestellt wird, zeigt zunehmend ihre menschliche Seite und ihre Sorge um ihre Untergebenen. Hiro, der oft als Einzelgänger agiert, findet durch die gemeinsame Mission eine neue Rolle innerhalb der Gruppe.

Die Handlung ist geprägt von intensiven Kampfszenen, strategischen Manövern und Momenten der Spannung, während die Charaktere versuchen, das Geheimnis der Fragments zu lüften und ihre Mission zu erfüllen. Die OVA bietet eine Mischung aus Action, Drama und Science-Fiction-Elementen, die typisch für das Gundam-Franchise sind. Die Geschichte endet mit einem offenen Finale, das Raum für Spekulationen und Interpretationen lässt, während gleichzeitig die zentralen Konflikte und Charakterentwicklungen abgeschlossen werden.